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副主任：李新海（主持工作）
刘录祥
韩天富
［作物遗传育种系简介］
作物遗传育种系现有在编固定人员40人，其中中国科学院院士1人，博士生导师6人，研究员11人、副研20人、助研6人、研究实习员、农艺师和实验师各1人。近年来，在院所领导和全系职工的努力下，在思想认识、科研创新和精神文明建设等方面都取得了较大进步。
注重学科建设。通过学科规划，明确研究方向和研究内容。作物遗传育种系将围绕作物遗传育种学科发展趋势，从保障我国粮食安全、促进农民增收和农业产业结构战略性调整的需要出发，以构筑现代高效育种技术体系、培育有突破性的新品种为目标，重点研究小麦、玉米、大豆、水稻、高粱等主要农作物的品质、产量、抗性、营养高效等相关性状遗传规律，发掘具有重大应用价值的新基因，完善育种理论和技术方法体系；创造具有重大应用前景的优异育种新材料，培育突破性的优质超高产农作物新品种；为全国不同生态区的育种机构提供具有突破性的优异新种质和新材料、育种新方法和新技术，为大面积生产提供新品种。
强化科研创新。近四年来，作物遗传育种系共承担了206项研究课题，80%为国家级重点课题，包括863计划、“973”计划、948项目、国家自然科学基金、国家科技攻关、农业科技跨越计划、国际合作课题；课题总经费超过3000万元；通过国家级或省级审定的新品种20个，累计推广面积2000多万亩；在国内外刊物发表论文200余篇，其中2003年在国内影响因子0.5以上的论文33篇，SCI收录5篇；为我国主要作物生产和遗传改良做出了较大贡献。
重视种质改良和育种网络。依托作物基因资源与基因改良国家重大科学工程、农作物改良中心（分中心）、农业部重点实验室、国家种质资源库和种质资源保存中心，联合我国农作物主产区的优势单位和国际农业组织，组建农作物种质改良和穿梭育种网络，设立试验站，拓宽合作渠道，加强学术交流；完善建设《中国小麦网》和《中国玉米网》。
加强精神文明建设。全系职工团结协作，坚持科研工作为经济建设服务的方针，积极参与改革；加强政治理论学习，结合时事，深刻领会和实践“三个代表”重要思想的内涵，并用于指导实际工作，时刻保持思想认识的先进性。根据院所安排，注重职工的政治理论学习，努力提高职工的思想、道德和文化修养；积极参加院所组织的各项活动；遵守国家法律、法规和各项规章制度，做到安全生产，严禁发生违反安全保卫、交通等责任事故。加强环境卫生建设，保持科研工作有一个稳定又优美的环境。
主要课题组：
小麦品质育种
小麦超高产育种
小麦诱变遗传与生物技术育种
冬麦北移
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