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玉米分子育种创新团队提出混合样品分析新策略

 来源:ICS 发布时间:2016年9月21日 作者点击数



近日,作物科学研究所玉米分子育种技术和应用创新团队邹枨、王平喜、徐云碧将DNA混池分析方法扩展为具有普遍适用性的混合样品分析(bulked sample analysis),系统地阐述了适用于混合样品分析的群体、抽样和混合策略、标记类型和鉴定平台、实验设计原则及分析流程。相关评论和观点文章《混合样品分析在遗传学、基因组学和作物改良中的应用》 (Bulked sample analysis in genetics, genomics and crop improvement. Plant Biotechnology Journal 14: 1941–1955)发表在《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)上。

据介绍,上世纪90年代提出的混合分离体分析(bulked segregant analysis)或DNA混池分析(pooled DNA analysis)在遗传学研究上得到广泛应用。随着高通量测序和分析技术的发展,DNA混池分析大大降低了分析成本,因而得到更为广泛的应用。玉米分子育种创新团队拓展的混合样品分析方法可用于基因定位、 挖掘和克隆。它不受物种、群体或基因型分析平台的限制,与物种是否具有参考基因组的无关;既可以应于自然群体中,也可以应用于双亲分离群体;混合样品分析适合于不同的基因型鉴定平台,包括单个的分子标记、高密度标记芯片和基于测序的分子标记系统等。混合样品分析可在不同的分子水平上进行,包括 DNA、RNA和蛋白质。研究人员可以从任何遗传或育种群体中采集极端个体,分类后进行混合样品的对比分析,也可以针对仅存的某种极端类型进行混合样品分析。高通量的基因型鉴定技术与混合样品分析相结合已经成为快速挖掘优良等位基因及变异、开发重要农艺性状分子标记的强大工具。混合样品分析为利用基因组学技术和优异种质资源,挖掘重要农艺性状基因并应用于作物改良提供了捷径。

玉米分子育种创新团队近年来多次在国内外重要学术会议上介绍混合样品分析新策略。2016年5月17 -21日在“中德植物育种方法创新研讨会”上,邹枨博士系统介绍了混合样品分析方法及其在遗传学、基因组学和作物改良中的应用。2016年8月16日在第七届国际作物科学大会上,创新团队首席科学家徐云碧博士作了题为“利用混合样本分析挖掘生物和非生物胁迫遗传因子”的报告。与此同时,该创新团队与国内外同行合作,已将混合样品分析策略应用于玉米大斑病和灰斑病抗性、低磷和渍害耐性等多个农艺性状的基因挖掘,并取得了预期的效果。

该论文自从今年3月正式接受并上线以来已引起国内外同行的广泛关注,短期内被大量下载并引用。

相关论文见以下连接: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.12559/full

 

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